Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SMTNP53814 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMTNP53814 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMTNP53814 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMTNP53814 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMTNP53814 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMTNP53814 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMTNP53814 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMTNP53814 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMTNP53814 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms