Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC3P51654 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms