Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms