Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 SPANXD-201ENST00000370515 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC113346.2-201ENST00000502684 457 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC012186.3-201ENST00000623850 485 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 PRAMEF35P-201ENST00000458709 891 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRXP46100 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 OR2A5-201ENST00000408906 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC245884.8-201ENST00000599382 880 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRXP46100 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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