Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2B1P20020 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms