Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms