Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LTAP01374 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LTAP01374 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms