Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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