Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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