Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CCDC142Q17RM4 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CCDC142Q17RM4 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CCDC142Q17RM4 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CCDC142Q17RM4 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CCDC142Q17RM4 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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CCDC142Q17RM4 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CCDC142Q17RM4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CCDC142Q17RM4 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CCDC142Q17RM4 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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