Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms