Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RPSAP19-201ENST00000431241 880 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 PTDSS1-206ENST00000522072 1112 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 AP001107.8-201ENST00000530805 479 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 Metazoa_SRP.85-201ENST00000610909 260 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 GNRH2-203ENST00000380346 353 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 SNHG14-207ENST00000452731 1064 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 Metazoa_SRP.198-201ENST00000610617 323 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 CGREF1-209ENST00000640154 336 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NESP48681 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 CACNG1-201ENST00000226021 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 SUCLG2P2-201ENST00000307241 1296 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 CLDN16-202ENST00000456423 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 RN7SL756P-201ENST00000488739 268 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 AC090236.1-201ENST00000590318 768 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 MIR6750-201ENST00000617817 75 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NESP48681 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 LINC01849-201ENST00000414647 517 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 TSEN15P3-201ENST00000422363 367 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 AL031773.1-201ENST00000453579 554 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 SSR3-202ENST00000463503 596 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 AFMID-210ENST00000589256 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 AL358215.3-201ENST00000640695 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NESP48681 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 AC008040.3-201ENST00000493762 1232 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 RAD52-212ENST00000541619 560 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 AC126471.1-201ENST00000550676 362 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 AC137932.2-201ENST00000562995 1205 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 AC104982.2-201ENST00000584258 893 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 ERGIC3-220ENST00000640748 832 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NESP48681 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 CDK7-202ENST00000502604 1455 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 TTLL1-202ENST00000331018 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 CTF2P-201ENST00000412003 604 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 AP001625.3-201ENST00000416179 449 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 AC074085.2-201ENST00000416734 428 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269 ms