Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR5P32302 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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