Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms