Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 DDX6P2-201ENST00000619520 1455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 ACTBP1-201ENST00000417985 1113 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 RN7SL105P-201ENST00000475661 299 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AD000091.1-201ENST00000592379 287 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GLI3P10071 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 IGLV3-21-201ENST00000390308 602 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AC006372.1-201ENST00000449903 546 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AC079944.2-201ENST00000478867 734 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 TBC1D21-201ENST00000300504 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 PIN1P1-202ENST00000439639 301 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 UBR1-212ENST00000627960 189 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GLI3P10071 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms