Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms