Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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