Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HELTA6NFD8 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HELTA6NFD8 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms