Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZCCHC17Q9NP64 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms