Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms