Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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