Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GAPVD1Q14C86 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC010547.1-202ENST00000567341 230 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 LMX1A-203ENST00000367893 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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