Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPIBQ01892 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms