Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CST2-201ENST00000304725 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 AL356414.1-201ENST00000379526 686 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 AL357054.1-201ENST00000407035 1227 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 AL354707.1-204ENST00000451142 846 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 AL356479.1-202ENST00000456933 714 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 FAM86B1-215ENST00000533513 725 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 AC087190.3-201ENST00000562893 753 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 AC245748.2-201ENST00000588655 574 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 DLG2-AS1_2.1-201ENST00000614607 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 AC021683.4-201ENST00000623348 1099 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 WFDC2-201ENST00000217425 356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 GMNN-202ENST00000356509 1133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 MRPL55-212ENST00000366739 641 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 AC140481.1-202ENST00000436488 525 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 AC091057.1-201ENST00000501830 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 AL162464.2-201ENST00000557761 526 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 AC092471.2-201ENST00000637219 651 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 HP-203ENST00000357763 1482 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 UPF3B-204ENST00000619445 1385 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NESP48681 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 CSMD2-202ENST00000338325 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 AC246680.1-201ENST00000444624 494 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 IGKV1-8-201ENST00000495489 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 AC003072.1-201ENST00000510957 612 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 ABCC6P1-202ENST00000565118 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 AC106872.1-201ENST00000512492 1360 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 CYP20A1-210ENST00000613925 1986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 EXOC7-206ENST00000406660 718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 HUS1-202ENST00000432325 1125 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 KIAA1191-211ENST00000533553 560 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 AC069234.1-201ENST00000542620 583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 AC116553.1-201ENST00000561752 397 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 PRSS2-206ENST00000633969 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 AL513478.3-201ENST00000641038 1095 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NESP48681 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 KLK8-201ENST00000291726 853 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 RPS21-202ENST00000370562 1002 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 SKA1-203ENST00000417656 1095 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 OR10AA1P-201ENST00000417823 937 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 PHBP11-201ENST00000420550 809 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 APOBEC3H-203ENST00000421988 592 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 MIR646HG-204ENST00000427820 805 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NESP48681 AC010240.1-201ENST00000429606 459 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms