Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms