Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 RN7SL328P-201ENST00000484033 300 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 OR52P2P-201ENST00000527287 955 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC137932.2-201ENST00000562995 1205 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 TEX101-203ENST00000602198 1446 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 AP003717.2-201ENST00000534962 898 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC021439.1-201ENST00000562975 591 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC015563.2-201ENST00000579580 772 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 C2orf27AP2-201ENST00000438438 555 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC013356.4-201ENST00000558421 482 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL353801.2-201ENST00000436877 1444 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DMDP11532 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 GINS4-203ENST00000518671 1158 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC002351.1-201ENST00000546852 590 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DMDP11532 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 GSTA4-201ENST00000370959 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC246680.1-201ENST00000444624 494 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC005154.1-227ENST00000579174 755 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 KRTAP10-9-203ENST00000616529 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC007322.2-201ENST00000414540 605 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 AC006001.3-205ENST00000428370 579 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 FAM92B-203ENST00000629253 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 AL160408.6-201ENST00000632063 1257 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DMDP11532 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms