Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERPINC1P01008 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms