Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms