Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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