Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC27P30260 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC27P30260 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC27P30260 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC27P30260 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC27P30260 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC27P30260 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC27P30260 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC27P30260 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC27P30260 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC27P30260 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC27P30260 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC27P30260 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC27P30260 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC27P30260 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC27P30260 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC27P30260 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC27P30260 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC27P30260 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC27P30260 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC27P30260 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC27P30260 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms