Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PPATP1-201ENST00000496669 1547 ntBASIC19.46■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 MYL2-201ENST00000228841 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 FOLR1-201ENST00000312293 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 PAGE4-202ENST00000376141 487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 CCDC103-203ENST00000410027 571 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AL356479.1-202ENST00000456933 714 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 IGKV1-8-201ENST00000495489 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 LINC02354-202ENST00000548564 573 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 GDPD1-205ENST00000581140 1265 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 CLPP-204ENST00000596149 745 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AC078880.3-201ENST00000603439 1121 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 UPF3B-204ENST00000619445 1385 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AC105415.1-201ENST00000509015 1416 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AP001625.3-201ENST00000416179 449 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 TRAIP-202ENST00000469027 1145 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AC069366.2-201ENST00000583643 430 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AC245748.2-201ENST00000588655 574 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 RN7SL238P-201ENST00000613832 290 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.139-201ENST00000616096 290 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 RN7SL106P-201ENST00000618104 290 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 HIST1H2APS4-202ENST00000635537 681 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AC092471.1-202ENST00000637160 999 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 CLUHP3-207ENST00000563678 1303 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AP000925.1-201ENST00000425960 1449 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AKTIP-201ENST00000300245 2133 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 CTF2P-201ENST00000412003 604 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 TRBV22-1-201ENST00000424543 337 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 SNHG11-211ENST00000444816 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 SNHG11-214ENST00000457218 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 OR7E126P-201ENST00000526217 888 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 KIAA1191-211ENST00000533553 560 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AC015563.2-201ENST00000579580 772 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 PRKN-210ENST00000612540 603 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 FURIN-208ENST00000640725 224 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRMP28827 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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