Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms