Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms