Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3CA6NKF2 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms