Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KCNIP3Q9Y2W7 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KCNIP3Q9Y2W7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KCNIP3Q9Y2W7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KCNIP3Q9Y2W7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
KCNIP3Q9Y2W7 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KCNIP3Q9Y2W7 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KCNIP3Q9Y2W7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KCNIP3Q9Y2W7 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 CXorf38-203ENST00000378426 4895 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KCNIP3Q9Y2W7 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms