Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms