Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms