Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
RPS29P62273 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
RPS29P62273 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
RPS29P62273 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms