Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI2P48788 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms