Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCLCP48506 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLCP48506 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLCP48506 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms