Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA13P31271 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms