Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms