Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms