Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNAP12004 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNAP12004 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNAP12004 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNAP12004 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNAP12004 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNAP12004 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNAP12004 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNAP12004 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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