Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 LPXN-203ENST00000528954 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TTC16-201ENST00000373289 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC018645.3-201ENST00000628855 2646 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 LINC01561-201ENST00000369071 2176 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.4 ms