Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms