Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CLIP4Q8N3C7 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CLIP4Q8N3C7 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CLIP4Q8N3C7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CLIP4Q8N3C7 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CLIP4Q8N3C7 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CLIP4Q8N3C7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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