Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD55Q3KP44 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms