Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ACTBP60709 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
ACTBP60709 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ACTBP60709 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ACTBP60709 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ACTBP60709 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ACTBP60709 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ACTBP60709 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
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