Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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